紅外線又稱熱射線，為0.77～1000μm波長之電磁波。按波長的差別，大致可分為3段： 0.77～3.0μm為近紅外區，3.0～30.0μm為中紅外區，30.0～1000μm為遠紅外區。紅外線有良好熱效應，熱能直接由放射電磁波產生，不需經介質傳導，故升溫快，有利于消毒。
 

紅外線殺菌作用的強弱，依其產生溫度的高低而定。滅菌所需溫度和時間，與干烤相同 (見“熱力消毒”條)。紅外線熱效應僅產生于所照到的表面，故僅適用于表面平坦或導熱性強物品的處理，如手術器械、注射器及其他玻璃器皿等。為使物品受熱均勻，可采用多面照射或旋轉式單側照射(見圖)。
 

紅外線光源愈強，熱效應愈高。距光源愈遠，熱效應愈差。各種顏色表面對紅外線的吸收率不同，吸收率愈高，溫度效應愈好。黑色吸收率最高，達87%，其他依次為灰(75%)、綠(73%)、紅 (64%)、黃(50%)、白(46%)。
 

消毒用遠紅外線快速恒溫烤箱，最高溫度達200℃，較電熱烤箱節電50%以上。自動輸送式紅外線烤箱，溫度可達180℃，物品由傳送帶連續送入，經30min傳出即達滅菌。物品大小或導熱性能不同，可裝于不同顏色金屬容器內以使得到同樣熱量處理，既能保證滅菌效果，又不致損壞物品。高真空紅外線烤箱，先抽真空，然后加熱至280℃，作用7min，即達滅菌，冷卻時可充入無菌氮氣以防氧化，全程僅需15min。
 

紅外線消毒較電熱干烤升溫快，對物品損壞較輕，更適于連續性生產。其設備較微波加熱裝置便宜，易推廣，現已用于食品工業以及醫院與微生物實驗室等工作中的消毒。